La regulación de la transcripción juega un papel importante en la actividad bacteriana. El concepto de operón acuñado por François Jacob y Jacques Monod ha tenido un efecto considerable en las investigaciones sobre la regulación de la expresión génica, incluido el modelado. Sin embargo, la mayoría de estos estudios han considerado los modelos de regulación diseñados manualmente para uno o varios operones. Por esa razón, el objetivo del presente estudio fue la reconstrucción automatizada de modelos genómicos para diferentes bacterias. El algoritmo propuesto tuvo en cuenta todas las posibles interacciones de los factores de transcripción y sus sitios de unión en la región promotora de un operón. La enumeración de factores de transcripción se realizó utilizando la técnica de búsqueda en profundidad. Los modelos obtenidos son de interés para aquellos involucrados en la investigación de los efectos reguladores de los factores de transcripción en la expresión génica bacteriana en microbiología y biotecnología.