En este estudio, evaluamos los efectos terapéuticos de los alcaloides tipo protopina derivados de (Willd). R. Br. (MPTAs) en un modelo de ratón de inflamación intestinal inducida por lipopolisacáridos (LPS). El diseño experimental involucró la asignación de ratones en grupos distintos, incluyendo un grupo de control, un grupo modelo tratado con 6 mg/kg de LPS, un grupo de berberina tratado con 50 mg/kg de clorhidrato de berberina y grupos de MPTA de dosis baja, media y alta tratados con 6, 12 y 24 mg/kg de MPTAs, respectivamente. Se realizó un análisis histológico del íleon, yeyuno y duodeno utilizando tinción con Hematoxilina y Eosina (H&E). Además, se realizó la cuantificación de las células caliciformes intestinales (GCs) basándose en la tinción PAS. Los niveles séricos de IL-1beta, IL-6, IL-8 y TNF-alfa se cuantificaron utilizando un ensayo por inmunoabsorción ligado a enzimas (ELISA), mientras que los niveles de ARNm de TLR4, NF-B p65, NLRP3, IL-6 e IL-1beta se evaluaron mediante PCR cuantitativa (qPCR). Los niveles de proteína de TLR4, Md-2, MyD88, NF-B p65 y NLRP3 se determinaron utilizando Western blotting. Además, las secuencias de 16S rDNA de los taxones bacterianos se amplificaron y analizaron para determinar alteraciones en la microbiota intestinal de los ratones tras el tratamiento con MPTA. Se encontró que diferentes dosis de MPTAs provocaron efectos terapéuticos distintos, lo que llevó a una morfología intestinal mejorada y un aumento en la abundancia de GCs intestinales. Se observó una disminución significativa en los niveles de citoquinas proinflamatorias (IL-1beta, IL-6, IL-8 y TNF-alfa). Además, los niveles de proteína de TLR4, MyD88, NLRP3 y p-p65/p65 se redujeron notablemente con el tratamiento con MPTA. Además, el análisis de secuenciación de 16S rDNA reveló que la administración de 24 mg/kg de MPTAs facilitó la restauración de la composición microbiana.