La berberina, el alcaloide protoberberina cuaternario (QPA) más conocido, ha sido reportada como un inhibidor de la proteína SIK3 relacionada con el cáncer de mama. La berberina también parece reducir la expresión de las proteínas bcl-2 y XIAP, responsables de la inhibición de la apoptosis. Dado que surgieron algunos problemas en la terapia con berberina, estudiamos las propiedades de unión al ADN de la escholidina, otro alcaloide QPA. Se examinaron modelos de secuencias i-motif y G-cuádruplex presentes en el gen n-myc y el gen c-kit mediante CD, fluorescencia y RMN. Proporcionamos evidencia de que la escholidina no induce la estabilización de las secuencias i-motif, mientras que la interacción con las estructuras G-cuádruplex parece ser más significativa.