El propósito de este estudio fue aislar e identificar cepas de spp. de portainjertos y árboles de almendra y pistacho en Túnez. Veintiocho cepas fueron identificadas a través de la amplificación y secuenciación de los genes 16S rDNA y A. Se realizó un bioensayo de guisante para determinar la patogenicidad de las cepas. Las secuencias representativas de los genes 16S rDNA y A de ocho cepas de pistacho y siete cepas de almendra estaban estrechamente relacionadas (>98% de similitud) con accesiones de spp. en GenBank. El análisis filogenético basado en secuencias de 16S rDNA reveló que las cepas de color amarillo se agrupaban con . Los aislamientos de cepas de color rojo y naranja se separaron en un grupo diferente con y aislamientos. Once cepas afectaron el crecimiento de plántulas de guisante y mostraron diferentes niveles de virulencia. El número de brotes fue significativamente mayor en las plántulas inoculadas con cuatro cepas, mientras que las otras tres cepas causaron hasta un 80% de reducción en la altura de la planta y redujeron el crecimiento secundario de las raíces en comparación con las plántulas de guisante no inoculadas. Estas cepas, la mayoría de las cuales son epífitas de huéspedes asintomáticos, mostraron una fuerte patogenicidad durante el bioensayo de guisante y se establecieron endofíticamente en los tejidos de guisantes. Se detectaron diez y cinco genes en cuatro cepas y podrían representar un nuevo modelo de virulencia patogénica de plantas. Los resultados de nuestra encuesta mostraron que está presente pero no es prevalente en todos los huertos visitados de portainjertos y árboles de almendra y pistacho. Nuestras encuestas complementaron las inversiones que se están realizando en especies ornamentales en Túnez y revelaron la presencia de spp. asociadas a plantas no documentadas en cultivos económicamente importantes.