La harina de insectos (IM), recientemente autorizada para su uso en piensos acuáticos, se posiciona como una mercancía prometedora para la inclusión en piensos acuáticos. Sin embargo, los insectos también son ricos en quitina, un polisacárido estructural presente en el exoesqueleto, que no es digerido por los peces, lo que resulta en un menor rendimiento de los peces. A través de la aplicación de una presión dietética, este estudio tuvo como objetivo modular la microbiota intestinal del lubina europea hacia el enriquecimiento de bacterias quitinolíticas para permitir la aislamiento de nuevos probióticos capaces de mejorar el uso de dietas que contienen IM, superando las desventajas de la quitina. Se utilizaron cinco dietas isoproteicas (44%) e isolipídicas (18%): una dieta basada en harina de pescado (FM) (dieta CTR), una dieta suplementada con quitina (dieta CHIT5) y tres dietas con un 25% de harinas de insectos (HM25 y TM25, respectivamente) o harina de exuvias (dieta HEM25) como sustitutos parciales de la FM. Después de un ensayo de alimentación de 8 semanas, los resultados mostraron un claro efecto modulador hacia las bacterias formadoras de esporas por las dietas HM25 y HEM25, siendo esta última responsable de la mayoría de los aislados de peces quitinolíticos (FIs) obtenidos. La evaluación secuencial de la actividad hemolítica de los FI, la resistencia a antibióticos, la actividad quitinolítica total, la esporulación y la supervivencia en condiciones similares a las gastrointestinales identificó a FI645 y FI658 como los probióticos quitinolíticos más prometedores para aplicación in vivo.