Caracterización Molecular de un Aislado Recombinante del Virus de la Curvatura de la Hoja del Tomate Nueva Delhi Asociado con Brotes Severos en Calabacín en el Sur de Italia
Autores: Mastrochirico, Mariarosaria; Spanò, Roberta; De Miccolis Angelini, Rita Milvia; Mascia, Tiziana
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Caracterización Molecular de un Aislado Recombinante del Virus de la Curvatura de la Hoja del Tomate Nueva Delhi Asociado con Brotes Severos en Calabacín en el Sur de Italia
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Caracterización molecular
Virus de rizado de la hoja del tomate Nueva Delhi
ToLCNDV-Le
Genoma
ADN-A
ADN-B
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Se informa sobre la caracterización molecular de un aislado del virus de la curvatura de la hoja del tomate de Nueva Delhi (ToLCNDV), denominado ToLCNDV-Le. El virus se asoció con brotes severos y recurrentes en cultivos protegidos de calabacín cultivados en la provincia de Lecce (Apulia, sur de Italia). El genoma completamente secuenciado de ToLCNDV-Le consta de dos componentes genómicos llamados DNA-A y DNA-B de 2738 y 2683 nt de tamaño, respectivamente. Al igual que otros aislados de ToLCNDV, el DNA-A de ToLCNDV-Le contiene los marcos de lectura abiertos (ORFs) AV2 y AV1 en la orientación de sentido virión y cinco ORFs adicionales llamados AC1, AC2, AC3, AC4 y AC5 en la orientación de sentido complementario. El DNA-B contiene el ORF BV1 en la orientación de sentido virión y el ORF BC1 en la orientación de sentido complementario. No se encontraron betasatelites de ADN asociados con ToLCNDV-Le en muestras infectadas de forma natural. El análisis filogenético agrupó a ToLCNDV-Le con la cepa ToLCNDV-ES de aislados de la cuenca del Mediterráneo occidental. En consecuencia, se propone el nombre ToLCNDV-ES-[IT-Zu-Le18] como descriptor para ToLCNDV-Le. Utilizando el programa de detección de recombinación RDP4, se identificó un posible punto de ruptura de recombinación (Rbp) cerca de las posiciones nucleotídicas 2197-2727, cubriendo aproximadamente la mitad de la región AC1, incluyendo el ORF AC4 y el 3 UTR. RDP4 indicó que el evento representa un Rbp de un aislado similar a ToLCNDV [Pk-06] (Acc. No. EF620534) encontrado en Pakistán e identificado como posible padre menor en el fondo de ToLCNDV [BG-Jes-Svr-05] (Acc. No. AJ875157), encontrado en tomate en Bangladesh e identificado como posible padre mayor. Hasta donde sabemos, este es el primer informe de un aislado recombinante de ToLCNDV-ES en la región AC1-AC4 en Italia.
Descripción
Se informa sobre la caracterización molecular de un aislado del virus de la curvatura de la hoja del tomate de Nueva Delhi (ToLCNDV), denominado ToLCNDV-Le. El virus se asoció con brotes severos y recurrentes en cultivos protegidos de calabacín cultivados en la provincia de Lecce (Apulia, sur de Italia). El genoma completamente secuenciado de ToLCNDV-Le consta de dos componentes genómicos llamados DNA-A y DNA-B de 2738 y 2683 nt de tamaño, respectivamente. Al igual que otros aislados de ToLCNDV, el DNA-A de ToLCNDV-Le contiene los marcos de lectura abiertos (ORFs) AV2 y AV1 en la orientación de sentido virión y cinco ORFs adicionales llamados AC1, AC2, AC3, AC4 y AC5 en la orientación de sentido complementario. El DNA-B contiene el ORF BV1 en la orientación de sentido virión y el ORF BC1 en la orientación de sentido complementario. No se encontraron betasatelites de ADN asociados con ToLCNDV-Le en muestras infectadas de forma natural. El análisis filogenético agrupó a ToLCNDV-Le con la cepa ToLCNDV-ES de aislados de la cuenca del Mediterráneo occidental. En consecuencia, se propone el nombre ToLCNDV-ES-[IT-Zu-Le18] como descriptor para ToLCNDV-Le. Utilizando el programa de detección de recombinación RDP4, se identificó un posible punto de ruptura de recombinación (Rbp) cerca de las posiciones nucleotídicas 2197-2727, cubriendo aproximadamente la mitad de la región AC1, incluyendo el ORF AC4 y el 3 UTR. RDP4 indicó que el evento representa un Rbp de un aislado similar a ToLCNDV [Pk-06] (Acc. No. EF620534) encontrado en Pakistán e identificado como posible padre menor en el fondo de ToLCNDV [BG-Jes-Svr-05] (Acc. No. AJ875157), encontrado en tomate en Bangladesh e identificado como posible padre mayor. Hasta donde sabemos, este es el primer informe de un aislado recombinante de ToLCNDV-ES en la región AC1-AC4 en Italia.