El hidrógeno molecular (MH) reportedly ejerce efectos terapéuticos contra enfermedades inflamatorias como un supresor de las reacciones en cadena de radicales libres. Aquí, se investigaron los efectos protectores cardiovasculares de la ingesta de agua de hidrógeno molecular (MHW) utilizando ratones con obesidad inducida por una dieta alta en grasas (DIO). MHW se preparó utilizando varitas de proveedor y agua desgasificada como control. La ingesta de MHW durante 2 semanas no mejoró el azúcar en sangre ni el peso corporal, pero disminuyó el peso del corazón en ratones DIO. Además, la ingesta de MHW mejoró la hipertrofia cardíaca, acortó el ancho de los cardiomiocitos, dilató los capilares y arteriolas, activó la fosforilación de eNOS-Ser-1177 en el miocardio y restauró la función del ventrículo izquierdo en ratones DIO. La ingesta de MHW promovió la conversión histológica de hipertrofia a hiperplasia en los tejidos adiposos blanco y marrón (WAT y BAT) con la regulación al alza de genes termogénicos y protectores cardiovasculares en BAT. Además, los resultados de un ensayo de formación de colonias de células progenitoras endoteliales (EPCs) derivadas de médula ósea indicaron que MHW activó la expansión, diferenciación y movilización de EPCs para mantener la homeostasis vascular. Estos hallazgos indican que la ingesta de MHW ejerce efectos protectores cardiovasculares en ratones DIO. Por lo tanto, beber MHW es una estrategia profiláctica potencial contra trastornos cardiovasculares en el síndrome metabólico.