El carbono (C) fijado por los cultivos, que se exporta con la cosecha y se retiene como residuos postcosecha en un campo, es importante para calcular el balance de C. El objetivo de este estudio fue determinar el efecto de la disponibilidad de agua en el contenido de C en plantas de trigo entero. En un ensayo de campo de tres años, se determinaron los pesos de grano, paja, cascarilla, rastrojo y raíces de dos cultivares de trigo de invierno y un cultivar de trigo einkorn y sus contenidos de carbono en tratamientos de estrés hídrico, riego y control de secano. La disponibilidad de agua, el año y el cultivar tuvieron una influencia significativa en el contenido de C en las partes aéreas de la planta, pero el efecto del agua en el C del grano fue débil. El contenido de C disminuyó con el riego y aumentó con la sequía, pero las diferencias fueron pequeñas (como máximo, 3.39% en cascarilla). En promedio, los contenidos de C de grano, paja, cascarilla y raíces alcanzaron 45.0, 45.7, 42.6 y 34.9%, respectivamente. La cantidad de C exportada con el grano y dejada en el campo en forma de residuos postcosecha dependió del peso de la biomasa total y de la relación entre grano y paja y residuo. El rendimiento total de C de la planta alcanzó 8.99, 7.46 y 9.65 t ha en tratamientos de control de secano, estresados e irrigados, respectivamente, y 8.91, 9.45 y 7.47 t ha en Artix, Butterfly y Rumona, respectivamente. El riego aumentó significativamente el contenido de C en el grano y la paja (pero no en la cascarilla, el rastrojo y las raíces) en comparación con las condiciones de escasez de agua. En promedio, un rendimiento de grano de 1 t ha correspondió a una exportación promedio de 0.447-0.454 t C ha en el grano de todos los cultivares y entradas de 0.721, 0.832 y 2.207 t C ha de residuo al suelo en forma de paja y residuo postcosecha en los dos cultivares de trigo común y uno de einkorn. Los resultados del estudio proporcionaron datos fiables para el cálculo del balance de C del trigo en condiciones de diferente disponibilidad de agua.