Antecedentes: la enfermedad de la mancha temprana causada por es una de las enfermedades más destructivas del tomate, reduciendo la producción de tomate a nivel mundial. Métodos: se recopilaron cuatro aislamientos fúngicos de cuatro cultivares de tomate e identificaron mediante caracterización morfológica y amplificación por reacción en cadena de la polimerasa (PCR) de la región del espaciador del transcrito interno (ITS), y los extractos de metanol y los bioagentes se utilizaron como agentes antifúngicos in vitro e in vivo y se compararon con clorotalonil, un fungicida químico de referencia. El análisis por HPLC de los extractos de plantas se utilizó para identificar los principales compuestos flavonoides, a saber, la rutina y la miricetina. Resultados: la caracterización molecular mostró que los aislamientos fúngicos pertenecían a . Los resultados de los estudios de actividad antifúngica in vitro revelaron que el clorotalonil, a una concentración de 2500 mg/L, mostró el mayor porcentaje de inhibición del crecimiento fúngico (PIGF) contra (84.4%), seguido de los bioagentes y , con valores de PIGF de 72.9% y 67.9%, respectivamente. Se encontró una actividad moderada a débil contra cuando se aplicaron los extractos de y a una concentración de 2500 mg/L, con un valor de PIGF del 54% para ambos extractos. Los resultados de la aplicación de pulverización in vivo mostraron que y el clorotalonil, así como , redujeron significativamente el índice de enfermedad de la mancha temprana, seguidos por los extractos de y . Mediante HPLC, se identificaron los compuestos flavonoides rutina y miricetina en (hoja) con cantidades de 2429.60 y 75.92 mg/100 g de extracto, y en (fruto), con cantidades de 1891.60 y 241.06 mg/100 g de extracto, respectivamente. Conclusiones: los resultados de la bioactividad de los extractos de plantas y los bioagentes indican un papel vital como actividad antifúngica contra .