Las enteropatías inflamatorias crónicas (EICs) en perros se clasifican actualmente en función de la respuesta a ensayos de tratamiento secuenciales en enteropatías sensibles a alimentos (ESAs); enteropatías sensibles a antibióticos (ESAs); enteropatías sensibles a inmunosupresores (ESISs); y enteropatías no sensibles (ENSs). Estudios recientes han informado que una proporción de perros con ENS finalmente responden a ensayos dietéticos adicionales y son clasificados incorrectamente. Por lo tanto, el subconjunto de ESA entre las EICs probablemente está subestimado. Además, se ha demostrado que las alteraciones en la composición y función de la microbiota intestinal (disbiosis) están involucradas en la patogénesis de las EICs en investigaciones recientes sobre perros. Se ha demostrado que el metronidazol y otros antibióticos que se han utilizado durante décadas para perros con ESAs resultan en un aumento de la resistencia antimicrobiana y efectos perjudiciales en la microbiota intestinal. Como consecuencia, el enfoque clínico hacia las EICs ha evolucionado en los últimos años hacia el abandono gradual del uso de antibióticos y su reemplazo por otros tratamientos con el objetivo de restaurar una microbiota intestinal diversa y funcional. Proponemos aquí refinar la clasificación de las EICs caninas reemplazando la categoría de ESAs por una categoría de enteropatías relacionadas con la modulación de la microbiota (ErMREs).