Las secreciones de los tricomas glandulares de las hojas y flores de tabaco contienen abundantes metabolitos secundarios de diferentes compuestos, como cebradanes, labdanes y ésteres de sacáridos. Estos metabolitos secundarios han mostrado propiedades biológicas interesantes, como actividad antimicrobiana, insecticida y antioxidante. En este estudio, se utilizaron 81 germoplasmas de tabaco curados al aire/sobre el sol como materiales experimentales. Se realizaron análisis cuantitativos y cualitativos de los componentes de la secreción glandular utilizando cromatografía líquida de ultra rendimiento-espectrometría de masas con tiempo de vuelo cuadrupolar (UPLC-Q-TOF MS) y cromatografía de gases-espectrometría de masas (GC-MS). Se evaluaron los extractos de etanol de los tricomas glandulares de las hojas y flores de tabaco por su actividad antifúngica contra el hongo utilizando el método de tasa de crecimiento micelial. Luego se realizó un análisis de Mínimos Cuadrados Parciales Ortogonales (OPLS) para determinar la relación entre los componentes de la secreción de los tricomas y su actividad antifúngica. Los resultados mostraron diferencias significativas entre las actividades antifúngicas de los extractos de etanol de los tricomas glandulares de tabaco probados. Las tasas de inhibición de los extractos de las hojas superiores y flores fueron significativamente más altas que las de las hojas medias e inferiores, y 59 germoplasmas (73.75% de los recursos probados) mostraron tasas antifúngicas superiores al 50%, con cuatro germoplasmas alcanzando una tasa antifúngica del 95% a la misma concentración de peso fresco (10 mg/mL). El análisis OPLS reveló que la actividad antifúngica estaba asociada principalmente con el alfa-cebratrieno-diol (alfa-CBT-diol (Pico7)) y el beta-cebratrieno-diol (beta-CBT-diol (Pico8)), seguido de los ésteres de sacarosa III (SE(III)) y el óxido de ceabratrieno-diol. Estos hallazgos ayudan a identificar excelentes germoplasmas de tabaco para el desarrollo y utilización de pesticidas botánicos contra hongos y proporcionan una referencia teórica para la utilización multipropósito de los germoplasmas de tabaco.