Las poblaciones fenotípicamente heterogéneas de macrófagos residentes en tejidos y células madre desempeñan roles importantes en la regeneración del tejido muscular esquelético. Estudios previos utilizando modelos animales y de cultivo celular implicaron un efecto beneficioso de las especies de ácidos grasos (AG) en la regeneración de tejidos. Aquí, aplicamos un modelo experimental humano utilizando tejidos musculares extirpados de cirugías reconstructivas para estudiar los efectos de los AG en los macrófagos residentes y las células madre en el entorno natural del tejido muscular esquelético humano. Se incluyeron muestras de tejido muscular de 20 donantes en este estudio. Se determinó la expresión de 34 citoquinas/quimioquinas, utilizando análisis de proteínas multiplex. Los fenotipos de los macrófagos y las células madre se determinaron inmunohistoquímicamente. Los números de macrófagos CD80 se correlacionaron con los niveles de expresión de IL-1alfa, IL-1RA, IL-8, IL-17A y MCP-1, mientras que los recuentos de células madre PAX7 y MyoD se correlacionaron positivamente con el nivel de expresión de CXCL12alfa, un quimioatrayente reconocido para las células madre musculares. El tratamiento de secciones de tejido adicionales con AG reveló que los macrófagos CD80 o MARCO y las células madre PAX7 o MyoD aumentaron simultáneamente por los AG insaturados de cadena larga. En conjunto, esta es la primera demostración experimental de una activación coordinada de macrófagos y células madre en el tejido muscular esquelético humano.