Dado que los ácidos biliares (AB) representan uno de los enlaces metabólicos entre el intestino y el hígado, las concentraciones fecales de AB podrían alterarse en pacientes humanos con diferentes tipos de enfermedades hepáticas crónicas (EHC). En medicina veterinaria, hay escasa literatura disponible sobre su posible modificación durante las EHC caninas. El presente estudio tuvo como objetivo evaluar los AB fecales en perros con diferentes tipos de EHC, especialmente diferenciando entre perros con EHC con y sin afectación de las vías biliares (EAB vs no EAB). Cuarenta y seis perros fueron incluidos en este estudio. Se analizaron las heces caninas para la cuantificación del Ácido Cólico (AC), Ácido Chenodesoxicólico (ACD), Ácido Ursodesoxicólico (AUD), Ácido Desoxicólico (AD), Ácido Litocólico (AL), AB primarios (AC + ACD), AB secundarios (AUD + AD + AL) y la relación de AB primarios/secundarios (P/S). Los AB primarios, AC, ACD, la relación P/S y los AB totales fueron significativamente más altos en perros con EAB (n = 18) en comparación con los perros sin EAB (n = 28). Los AB secundarios, AUD, AD y AL no diferieron significativamente entre perros con y sin EAB. Los signos clínicos gastrointestinales fueron significativamente más prevalentes en perros con EAB en comparación con los perros sin EAB. Nuestros resultados coinciden con algunas evidencias en EHC humanas y podrían reflejar desequilibrios en la interacción hígado-intestino y deterioro de la función hepática.