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Aceleración de hardware para identificar códigos de barras en secuenciación nanoporosa multiplexada

Autores: Hu, Wenjie; Zhang, Yuxin; Zhang, Hongrui; Chen, Weigang

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2022

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Acceso abierto

Artículo científico
2022

Aceleración de hardware para identificar códigos de barras en secuenciación nanoporosa multiplexada


Categoría

Ingeniería y Tecnología

Subcategoría

Ingeniería Eléctrica y Electrónica

Palabras clave

Identificación
Secuenciación de ADN
Códigos de barras
Alto rendimiento
Acelerador de hardware
FPGA

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 29

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
En el secuenciamiento multiplexado, la identificación de códigos de barras de secuenciación de ADN puede reducir efectivamente la probabilidad de asignación errónea de muestras. Sin embargo, la gran cantidad de datos de secuencia requiere un método de identificación de alto rendimiento. Por lo tanto, basado en un esquema de identificación de códigos de barras que combina el desplazamiento cíclico con la programación dinámica (DP), este documento propone, implementa y prueba un acelerador de hardware que puede acelerar la identificación de códigos de barras.

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