Aceleración de hardware para identificar códigos de barras en secuenciación nanoporosa multiplexada
Autores: Hu, Wenjie; Zhang, Yuxin; Zhang, Hongrui; Chen, Weigang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Aceleración de hardware para identificar códigos de barras en secuenciación nanoporosa multiplexada
Categoría
Ingeniería y Tecnología
Subcategoría
Ingeniería Eléctrica y Electrónica
Palabras clave
Identificación
Secuenciación de ADN
Códigos de barras
Alto rendimiento
Acelerador de hardware
FPGA
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 29
Citaciones: Sin citaciones
En el secuenciamiento multiplexado, la identificación de códigos de barras de secuenciación de ADN puede reducir efectivamente la probabilidad de asignación errónea de muestras. Sin embargo, la gran cantidad de datos de secuencia requiere un método de identificación de alto rendimiento. Por lo tanto, basado en un esquema de identificación de códigos de barras que combina el desplazamiento cíclico con la programación dinámica (DP), este documento propone, implementa y prueba un acelerador de hardware que puede acelerar la identificación de códigos de barras.
Descripción
En el secuenciamiento multiplexado, la identificación de códigos de barras de secuenciación de ADN puede reducir efectivamente la probabilidad de asignación errónea de muestras. Sin embargo, la gran cantidad de datos de secuencia requiere un método de identificación de alto rendimiento. Por lo tanto, basado en un esquema de identificación de códigos de barras que combina el desplazamiento cíclico con la programación dinámica (DP), este documento propone, implementa y prueba un acelerador de hardware que puede acelerar la identificación de códigos de barras.