La reducción de las emisiones de metano originadas del sector ganadero es de alta importancia para enfrentar el cambio climático. En el presente estudio, se investigó el efecto del aceite esencial de orégano orgánico (OEO) incorporado en la dieta de cabras lecheras durante un período de 45 días, sobre la abundancia de la población de Methanobacteria en su rumen. Se recolectaron muestras en los días 15, 30 y 45 del ensayo de alimentación para investigar las alteraciones en las poblaciones microbianas, utilizando pares de cebadores tanto genéricos como específicos de arqueas. De los resultados, se observó que los animales que recibieron OEO se caracterizaron por tener menores abundancias de Methanobacteria a lo largo del tiempo en comparación con los animales que no recibieron la suplementación con OEO. Este efecto se observó utilizando ambos enfoques analíticos dirigidos a comunidades microbianas genéricas y específicas de arqueas. Estos hallazgos son importantes porque muestran un método prometedor y respetuoso con el medio ambiente para hacer la ganadería más sostenible.