La aplicación de abono verde ayuda a mantener la fertilidad del suelo, reducir el uso de fertilizantes químicos y la captura de carbono en el suelo. Sin embargo, la aplicación de materia orgánica en campos de arroz induce emisiones de CH y NO. La prolongación del drenaje a mitad de temporada reduce las emisiones de CH en los campos de arroz. Por lo tanto, se investigaron los efectos combinados de la aplicación de abono verde y la prolongación del drenaje a mitad de temporada en la emisión neta de gases de efecto invernadero (NGHGE). Cuatro tratamientos experimentales se establecieron durante un período de 2 años: drenaje convencional a mitad de temporada con (CMG) y sin (CM) abono verde y prolongación (4 o 7 días) del drenaje a mitad de temporada con (PMG) y sin (PM) abono verde. Las semillas de L. se sembraron en otoño e incorporaron antes del cultivo de arroz. No se observaron diferencias significativas en las emisiones anuales de CH y NO, la respiración heterotrófica y el NGHGE entre los tratamientos, lo que indica que la aplicación de abono verde y la prolongación del drenaje a mitad de temporada no influyeron en el NGHGE. El flujo de CH disminuyó drásticamente en PM y PMG durante el drenaje a mitad de temporada bajo condiciones climáticas calurosas y secas. Sin embargo, el aumento del carbono aplicado aumenta el NGHGE debido al aumento de CH y Rh. En consecuencia, la práctica combinada de la prolongación del drenaje a mitad de temporada y la utilización de abono verde puede ser aceptable sin cambiar el NGHGE, manteniendo el rendimiento de grano en campos de arroz bajo manejo orgánico.