Aunque el abandono de tierras agrícolas (LA) está acompañado de degradación del suelo, podría considerarse una especie de auto-rehabilitación. Los estudios han demostrado que el LA a largo plazo tiene profundos beneficios ecológicos y ambientales, mientras que pocos estudios han comparado el LA con la intervención humana (HI), que implica la siembra y fertilización en la restauración de agroecosistemas. Aquí, establecimos cuatro escenarios diferentes basados en la ganadería local, incluyendo LA sin HI, LA con ligera intervención humana (HIS), intervención humana media (HIM) e intervención humana intensiva (HII). Se realizaron experimentos de LA durante 3 años y se muestrearon repetidamente tres veces. Se determinaron las comunidades bacterianas y fúngicas del suelo para presentar los impactos ecológicos. En este estudio, el LA y el HIS podrían ahorrar carbono inorgánico del suelo y contenidos totales de calcio (Ca) y beneficiar a los hongos micorrízicos del suelo y a las rizobacterias promotoras del crecimiento de las plantas. El LA y el HIM beneficiaron a algunas comunidades microbianas asociadas con compuestos orgánicos complejos. Los métodos de interferencia humana no aumentaron significativamente los nutrientes del suelo después de 3 años de abandono de tierras agrícolas. Sin embargo, la vegetación indígena aumentó el riesgo de enfermedades en las plantas basado en comunidades microbianas del suelo. El pasto forrajero puede controlar el riesgo, y el HIS fue un escenario rentable en nuestro estudio. Además, debemos mantener una actitud cautelosa hacia el HII para prevenir una intervención excesiva.