La afirmación de que la complejidad y la estructura del hábitat rigen la abundancia y diversidad de las comunidades biológicas ha sido ampliamente investigada. En este contexto, asumimos la hipótesis de la heterogeneidad del hábitat, es decir, que una mayor complejidad del hábitat conlleva una mayor diversidad de odonatos. Además, analizamos la influencia de la estructura del hábitat en la distribución de esta comunidad y evaluamos los efectos de las variables abióticas. Se recolectaron larvas de odonatos con tamices y mediante pesca eléctrica en diez arroyos neotropicales pertenecientes a la cuenca del río Pirapó. Se registraron cuarenta especies de odonatos, distribuidas en ocho familias, destacando Libellulidae, con la mayor riqueza. La alta diversidad gamma y la distribución de odonatos se asociaron con la heterogeneidad del hábitat en estos arroyos. Sin embargo, las variables abióticas también parecen afectar la distribución de las especies de odonatos, dado el impacto del uso del suelo en las proximidades de los arroyos.