() ¡Familia de genes en papa ( L.): identificación y análisis de expresión!
Autores: Gancheva, Maria; Dodueva, Irina; Lebedeva, Maria; Lutova, Ludmila
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
() ¡Familia de genes en papa ( L.): identificación y análisis de expresión!
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Genes
Péptidos
Papa
Expresión
Regulación
Transcripción
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 21
Citaciones: Sin citaciones
Los genes codifican un grupo de pequeños péptidos secretorios, que regulan la proliferación y diferenciación celular en las plantas. Los genes han sido estudiados en muchas plantas; sin embargo, se sabe poco sobre esta familia de genes en la patata. En este estudio, caracterizamos los miembros de la familia de genes en la patata y analizamos exhaustivamente sus relaciones filogenéticas, estructura y patrones de expresión. Usando datos transcriptómicos disponibles, encontramos un nivel de expresión relativamente alto de , y en estolones y tubérculos. El análisis de PCR en tiempo real mostró que el gen fue regulado al alza por la deficiencia de agua, mientras que la expresión de y fue inducida por el suministro de nitrógeno. Además, utilizando datos de estudios transcriptómicos obtenidos previamente para plantas con la inducción del gen, un regulador positivo del desarrollo de tubérculos, encontramos que estaba entre los genes regulados al alza en respuesta a la inducción, lo que sugiere que podría ser un objetivo del factor de transcripción StBEL5. Sin embargo, no revelamos una unión directa de StBEL5 a las secuencias regulatorias de utilizando el ensayo de levadura de híbrido uno. En conjunto, nuestros datos proporcionan información básica para futuros estudios funcionales de péptidos CLE en el crecimiento y tuberización de la patata y en respuesta a diversos estímulos ambientales.
Descripción
Los genes codifican un grupo de pequeños péptidos secretorios, que regulan la proliferación y diferenciación celular en las plantas. Los genes han sido estudiados en muchas plantas; sin embargo, se sabe poco sobre esta familia de genes en la patata. En este estudio, caracterizamos los miembros de la familia de genes en la patata y analizamos exhaustivamente sus relaciones filogenéticas, estructura y patrones de expresión. Usando datos transcriptómicos disponibles, encontramos un nivel de expresión relativamente alto de , y en estolones y tubérculos. El análisis de PCR en tiempo real mostró que el gen fue regulado al alza por la deficiencia de agua, mientras que la expresión de y fue inducida por el suministro de nitrógeno. Además, utilizando datos de estudios transcriptómicos obtenidos previamente para plantas con la inducción del gen, un regulador positivo del desarrollo de tubérculos, encontramos que estaba entre los genes regulados al alza en respuesta a la inducción, lo que sugiere que podría ser un objetivo del factor de transcripción StBEL5. Sin embargo, no revelamos una unión directa de StBEL5 a las secuencias regulatorias de utilizando el ensayo de levadura de híbrido uno. En conjunto, nuestros datos proporcionan información básica para futuros estudios funcionales de péptidos CLE en el crecimiento y tuberización de la patata y en respuesta a diversos estímulos ambientales.