Este artículo examina los desafíos que plantean los marcos legislativos nacionales en los Estados Miembros de la Unión Europea en relación con la gestión de proyectos de investigación y desarrollo (I+D) financiados con fondos públicos. Tomando como ejemplo el caso de España y su Ley General de Subvenciones, este estudio analiza 55 convocatorias de financiación de I+D publicadas por la Administración Central Española en 2021 y 2022. Esta investigación identifica los principales desafíos asociados con la gestión del cambio en estos proyectos. Se realizó una revisión detallada de la legislación relevante y su aplicación a los proyectos de I+D, junto con un análisis de las bases regulatorias utilizando un índice de flexibilidad (IF) para evaluar la adaptabilidad de las condiciones de las subvenciones. También se emplearon metodologías cuantitativas como el coeficiente de correlación de Pearson y el análisis de componentes principales. Los hallazgos revelan que la flexibilidad en la gestión de proyectos, particularmente en lo que respecta a cambios en el alcance, presupuesto y plazos, es limitada debido a la rigidez del marco legal. Esta falta de flexibilidad representa un desafío significativo para la ejecución efectiva de proyectos, que requiere inherentemente adaptabilidad para gestionar la incertidumbre. Esta investigación sugiere que las reformas futuras deberían priorizar una mayor flexibilidad legal para mejorar la eficiencia y el éxito de las iniciativas de I+D financiadas con fondos públicos. Estos hallazgos contribuyen a una comprensión más amplia de cómo las restricciones regulatorias impactan la gestión de la innovación.